MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 45192

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015508	CG	3	6	294605	294610	0 %	0 %	50 %	50 %	332715645
6002	NC_015508	CTT	2	6	294649	294654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715645
6003	NC_015508	CCA	2	6	294675	294680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715645
6004	NC_015508	AAT	2	6	294700	294705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332715645
6005	NC_015508	CGA	2	6	294708	294713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715645
6006	NC_015508	CG	3	6	294716	294721	0 %	0 %	50 %	50 %	332715645
6007	NC_015508	CCA	2	6	294840	294845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6008	NC_015508	ACG	2	6	295066	295071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_015508	GGC	2	6	295172	295177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_015508	GCC	2	6	295203	295208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6011	NC_015508	GATG	2	8	295231	295238	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_015508	GGCAA	2	10	295245	295254	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6013	NC_015508	CT	3	6	295375	295380	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6014	NC_015508	CCG	2	6	295402	295407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6015	NC_015508	ACC	3	9	295408	295416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6016	NC_015508	ATG	2	6	295509	295514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715646
6017	NC_015508	GTC	2	6	295558	295563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715646
6018	NC_015508	CG	3	6	295565	295570	0 %	0 %	50 %	50 %	332715646
6019	NC_015508	CAT	2	6	295613	295618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715646
6020	NC_015508	TGCG	2	8	295710	295717	0 %	25 %	50 %	25 %	332715646
6021	NC_015508	GGC	2	6	295747	295752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715646
6022	NC_015508	CTG	2	6	295969	295974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715646
6023	NC_015508	AAT	2	6	296002	296007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332715646
6024	NC_015508	GGCC	2	8	296032	296039	0 %	0 %	50 %	50 %	332715646
6025	NC_015508	CGC	2	6	296120	296125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715646
6026	NC_015508	TTG	2	6	296126	296131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715646
6027	NC_015508	CAT	2	6	296197	296202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715646
6028	NC_015508	CAT	2	6	296263	296268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715646
6029	NC_015508	TAA	2	6	296298	296303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332715646
6030	NC_015508	ATC	2	6	296516	296521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_015508	TGA	2	6	296536	296541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_015508	GTTC	2	8	296569	296576	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6033	NC_015508	ACT	2	6	296726	296731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715647
6034	NC_015508	TAG	2	6	296734	296739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715647
6035	NC_015508	CGTT	2	8	296750	296757	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6036	NC_015508	GCG	2	6	296806	296811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_015508	ATC	2	6	296866	296871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715648
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6039	NC_015508	TTC	2	6	296941	296946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715648
6040	NC_015508	ATC	2	6	296953	296958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715648
6041	NC_015508	TGC	2	6	297016	297021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715648
6042	NC_015508	GGC	2	6	297157	297162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715648
6043	NC_015508	TGA	2	6	297280	297285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715648
6044	NC_015508	ATGGC	2	10	297361	297370	20 %	20 %	40 %	20 %	332715648
6045	NC_015508	ATC	2	6	297463	297468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715648
6046	NC_015508	CCGA	2	8	297501	297508	25 %	0 %	25 %	50 %	332715648
6047	NC_015508	GCA	3	9	297536	297544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715648
6048	NC_015508	GCA	2	6	297582	297587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715648
6049	NC_015508	CGT	2	6	297748	297753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715648
6050	NC_015508	CGG	2	6	297865	297870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715648
6051	NC_015508	GCGA	2	8	297978	297985	25 %	0 %	50 %	25 %	332715648
6052	NC_015508	AG	3	6	298196	298201	50 %	0 %	50 %	0 %	332715648
6053	NC_015508	CGA	2	6	298277	298282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715648
6054	NC_015508	GCG	2	6	298339	298344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715648
6055	NC_015508	TCG	2	6	298357	298362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715648
6056	NC_015508	AGC	2	6	298372	298377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715648
6057	NC_015508	CGC	2	6	298452	298457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715648
6058	NC_015508	AGGC	2	8	298476	298483	25 %	0 %	50 %	25 %	332715648
6059	NC_015508	CGTG	2	8	298589	298596	0 %	25 %	50 %	25 %	332715648
6060	NC_015508	CGC	2	6	298653	298658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715648
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6063	NC_015508	ATC	2	6	298848	298853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715648
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6065	NC_015508	ATC	2	6	298929	298934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715648
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6073	NC_015508	AGC	2	6	299428	299433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715648
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6095	NC_015508	C	8	8	300683	300690	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6096	NC_015508	CACG	2	8	300804	300811	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6097	NC_015508	CGT	2	6	300947	300952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715649
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6100	NC_015508	GAAC	2	8	301020	301027	50 %	0 %	25 %	25 %	332715649
6101	NC_015508	TTA	2	6	301135	301140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332715649
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6103	NC_015508	ACGC	2	8	301264	301271	25 %	0 %	25 %	50 %	332715649
6104	NC_015508	A	6	6	301280	301285	100 %	0 %	0 %	0 %	332715649
6105	NC_015508	CCGC	2	8	301326	301333	0 %	0 %	25 %	75 %	332715649
6106	NC_015508	ATC	2	6	301335	301340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715649
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6108	NC_015508	TCA	2	6	301439	301444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_015508	GAC	2	6	301468	301473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_015508	GGC	2	6	301486	301491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_015508	ATC	2	6	301611	301616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_015508	TTGA	2	8	301640	301647	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_015508	CAT	2	6	301648	301653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_015508	CGAAAA	2	12	301716	301727	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6115	NC_015508	TGCA	2	8	301845	301852	25 %	25 %	25 %	25 %	332715650
6116	NC_015508	CG	3	6	301885	301890	0 %	0 %	50 %	50 %	332715650
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6119	NC_015508	ACA	2	6	302155	302160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715650
6120	NC_015508	AGAAA	2	10	302196	302205	80 %	0 %	20 %	0 %	332715650
6121	NC_015508	GA	3	6	302265	302270	50 %	0 %	50 %	0 %	332715650
6122	NC_015508	GAC	2	6	302272	302277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715650
6123	NC_015508	ATC	2	6	302308	302313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_015508	GCT	2	6	302325	302330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_015508	GC	4	8	302402	302409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6126	NC_015508	GCAG	2	8	302422	302429	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6127	NC_015508	GAC	2	6	302453	302458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_015508	CAC	3	9	302463	302471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6129	NC_015508	GAT	2	6	302478	302483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_015508	CAT	2	6	302573	302578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6131	NC_015508	ACA	2	6	302585	302590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6132	NC_015508	CAA	2	6	302643	302648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6133	NC_015508	TGC	2	6	302659	302664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6134	NC_015508	T	6	6	302689	302694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6135	NC_015508	GGC	2	6	302703	302708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6136	NC_015508	TGC	2	6	302718	302723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6137	NC_015508	CAT	2	6	302751	302756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6138	NC_015508	TGGG	2	8	302859	302866	0 %	25 %	75 %	0 %	332715651
6139	NC_015508	GCC	2	6	302876	302881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715651
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6141	NC_015508	GC	3	6	302936	302941	0 %	0 %	50 %	50 %	332715651
6142	NC_015508	CCG	2	6	302948	302953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715651
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6144	NC_015508	ATC	2	6	302977	302982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715651
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6165	NC_015508	AT	3	6	304034	304039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6166	NC_015508	ATT	2	6	304050	304055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6167	NC_015508	TTG	2	6	304113	304118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6168	NC_015508	ATC	2	6	304142	304147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6188	NC_015508	GACT	2	8	305115	305122	25 %	25 %	25 %	25 %	332715652
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6201	NC_015508	A	7	7	306013	306019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6202	NC_015508	TCC	2	6	306080	306085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6203	NC_015508	GTC	2	6	306087	306092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6221	NC_015508	AGGG	2	8	306796	306803	25 %	0 %	75 %	0 %	332715653
6222	NC_015508	GAAA	2	8	306821	306828	75 %	0 %	25 %	0 %	332715653
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6241	NC_015508	CTG	2	6	307771	307776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715653
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6243	NC_015508	GA	3	6	307812	307817	50 %	0 %	50 %	0 %	332715653
6244	NC_015508	CGC	2	6	307841	307846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715653
6245	NC_015508	CAGT	2	8	307847	307854	25 %	25 %	25 %	25 %	332715653
6246	NC_015508	TC	3	6	307873	307878	0 %	50 %	0 %	50 %	332715653
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6248	NC_015508	ACG	2	6	307939	307944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715653
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6252	NC_015508	CGG	2	6	308184	308189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6253	NC_015508	TATC	2	8	308210	308217	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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6372	NC_015508	CGA	2	6	315654	315659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715658
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6393	NC_015508	GGCT	2	8	317012	317019	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6394	NC_015508	CGA	2	6	317105	317110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715659
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6489	NC_015508	GC	3	6	322830	322835	0 %	0 %	50 %	50 %	332715662
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6492	NC_015508	ACC	2	6	323021	323026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715662
6493	NC_015508	ACC	2	6	323122	323127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715662
6494	NC_015508	TTC	2	6	323183	323188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715662
6495	NC_015508	TTC	2	6	323221	323226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715662
6496	NC_015508	GTG	2	6	323257	323262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715662
6497	NC_015508	CGG	2	6	323321	323326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715662
6498	NC_015508	T	6	6	323467	323472	0 %	100 %	0 %	0 %	332715662
6499	NC_015508	CCTCG	2	10	323502	323511	0 %	20 %	20 %	60 %	332715662
6500	NC_015508	TCC	2	6	323519	323524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715662

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